A FCT/UNL acolhe 16 centros de investigação reconhecidos pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia (dos quais 3 classificados com "Exceptional" e 4 com “Excellent”).
- CEFAGE - Centro de Estudos e Formação Avançada em Gestão e Economia
Coordenador: Prof. Doutor Duarte Brito
- CEFITEC - Centro de Física e Investigação Tecnológica
Coordenador: Prof. Doutor Paulo Limão Vieira
- CENSE - Center for Environmental and Sustainability Research
Coordenadora: Prof. Doutora Alexandra Ribeiro
- CIUHCT - Centro Interuniversitário de História das Ciências e da Tecnologia
Coordenadora: Prof. Doutora Maria Paula Diogo
- CMA - Centro de Matemática e Aplicações
Coordenador: Prof. Doutor Fabio Chalub
- CTS - Centro de Tecnologia e Sistemas
Coordenador: Prof. Doutor João Goes
- GeoBioTec - Geobiociências, Geoengenharias e Geotecnologias
Coordenador: Prof. Doutor José Carlos Kullberg
- I3N - Institute of Nanostructures, Nanomodelling and Nanofabrication
Coordenadora: Prof. Doutora Elvira Fortunato
- LIBPhys - Laboratory for Instrumentation, Biomedical Engineering and Radiation Physics
Coordenador: Prof. Doutor José Paulo Santos
- MARE - Marine and Environmental Sciences Centre
Coordenadora: Prof. Doutora Maria Helena Costa
- MEtRICs - Mechanical Engineering and Resource Sustainability Center
Coordenadora: Prof. Doutora Benilde Mendes
- NOVA LINCS - NOVA Laboratory for Computer Science and Informatics
Coordenador: Prof. Doutor Luís Caires
- REQUIMTE - Associated Lab. for Green Chemistry - Clean Technologies and Processes
Coordenador: Prof. Doutor Manuel Nunes da Ponte
- UCIBIO - Applied Molecular Biosciences Unit
Coordenadora: Prof. Doutora Maria João Romão
- UNIDEMI - Research and Development Unit in Mechanical and Industrial Engineering
Coordenador: Prof. Doutor Virgílio Cruz Machado
- VICARTE - Vidro e Cerâmica para as Artes
Coordenadora: Prof. Doutora Márcia Vilarigues
Coordenação Geral dos Centros de Investigação
Prof. Doutora Elvira Fortunato
Telefone: 21 294 85 62
Extensões: 11601/02
Fax: 21 294 85 58
E-mail: cenimat.secretariado@fct.unl.pt